函館競馬場はＪＲＡ全10場のなかでもっとも「直線の長さが短い競馬場」として知られている。芝コースの場合、４コーナーからゴールラインまでの距離は262.1ｍ（ダートコースは260.3ｍ）。東京競馬場の直線（525.9ｍ）の半分にも満たない。 ゴール板から１コーナーまでの距離がゆったり採られているレイアウトのために、函館競馬場の直線は短くなっている。

もうひとつの特徴は、“高低差がかなりある”ことだ。３～４コーナー付近の最高地点と、２コーナー付近の最低地点を比較した高低差は、芝、ダートともに3.5ｍ。これはローカル競馬場（札幌・函館・福島・新潟・中京・小倉）の中では最大（芝の3.5ｍは中京と並んで最大）の数値となっている。

後半開催を迎える頃の芝コースは馬場の傷みが進行して、かなり時計を要するコンディションとなってしまうことが多い。基本的には開催が進めば進むほど、タフな馬場状態を苦にしない“パワータイプの台頭”を頭に入れておく必要がある。